做试管婴儿会出现性染色体异常的情况主要是以下几点原因：

1、目前普通的试管婴儿技术（第一代试管婴儿、第二代试管婴儿）不能够进行染色体筛查，无法确认移植的胚胎是否存在性染色体异常的情况；

2、第三代试管婴儿技术也不是万能的，目前仅只能筛查出已知的80种遗传疾病，对于未知的遗传疾病目前并不一定能完全避免，所以说通过试管婴儿技术出生的孩子不一定就是完全健康的。

3、即使已经通过第三代试管婴儿技术筛查出，健康的没有染色体异常的胚胎进行移植，在胚胎生长发育的过程中，如果女性接触到会对胚胎影响较大的有毒物质，比如：药物、呼吸到空气中的有毒气体，以及使用含铅汞等物质的东西，就还是有可能会导致胎儿出现染色体变异的可能性。

虽然说第三代试管婴儿技术并不能完全避免胎儿出现染色体异常的情况，但是以目前的技术来看，第三代试管是降低胎儿出现染色体异常的最佳方法。主要是在试管过程中，取胚胎的遗传物质进行检查分析，诊断是否存在有异常的染色体，从中筛选出健康的胚胎进行移植，从而达到防止遗传病传递的目的，为患者优生优育提供了相当大的帮助。目前通过使用第三代试管婴儿技术，能够筛选甄别和检测的遗传性疾病确定的多达73种，帮助了成千上万的患者成功生育了健康的孩子。

然而目前并不是所有试管医院都拥有第三代试管婴儿技术，所以说如果患者想要自己找医院做第三代试管是非常繁杂的过程，如果患者有相关问题，那么就可以咨询医孕通客服，医孕通可以免费帮患者甄别筛选出最适合患者自身情况的试管医院，可以为广大患者做第三代试管提供相关的医院信息！